В январе 2021 года сообщения о новом варианте коронавируса, появившемся в Калифорнии, вызвали много опасений. Предварительные данные свидетельствуют о том, что он более передается, чем немутантные штаммы SARS-CoV-2 (вируса, вызывающего COVID-19), от которого он произошел.
Теперь многогранное сотрудничество между исследователями из Калифорнийского университета в Сан-Франциско, институтов Гладстона и других организаций по всей Калифорнии дает исчерпывающий портрет этого варианта, включая его взаимодействие с иммунной системой и его потенциал к распространению.
«Наши результаты показывают, что выращенный в Калифорнии вариант может заразить людей, у которых уже был COVID-19, но он уязвим для вакцин», — говорит Чарльз Чиу, доктор медицинских наук, директор Центра вирусной диагностики и открытий UCSF-Abbott. и один из соавторов исследования, опубликованного в журнале Cell . Он помог обнаружить и сообщить о новом варианте как о «вызывающем беспокойство» ранее в этом году Центрах по контролю за заболеваниями и другим учреждениям здравоохранения.
«Основная идея состоит в том, что вакцинацию следует делать всем, даже если вы были инфицированы раньше», — говорит Чиу. Новые находки публикуются в журнале Cell .
Отслеживание роста нового варианта
Как и все вирусы, SARS-CoV-2 со временем мутирует, и постоянно возникают новые варианты с различными комбинациями мутаций . Не все варианты вызывают беспокойство, но некоторые варианты, похоже, распространяются быстрее, чем другие. Считается, что это связано с мутациями, которые усиливают функцию белка шипа вируса, который он использует для захвата и заражения клеток человека.
Вариант Калифорнии на самом деле существует в двух разных формах, получивших название B.1.427 и B.1.429, и каждая имеет уникальную комбинацию мутаций. Но они спарены как один вариант, потому что у них есть несколько различных мутаций, которые влияют на спайковый белок.
«Когда этот вариант появился в Калифорнии, было важно определить, какой риск он может представлять», — говорит Мелани Отт, доктор медицинских наук, директор Института вирусологии Гладстона и соавтор исследования. . «Но нам нужно было секвенировать — или проанализировать — его геном и провести последующие эксперименты, чтобы действительно понять его».
Исследователи секвенировали образцы из 2172 тестов мазков на COVID-19, проведенных в десятках округов Калифорнии. Анализ последовательностей показал, что вариант появился в мае 2020 года и впоследствии дал начало двум текущим формам.
В период с 1 сентября 2020 года по 29 января 2021 года распространенность варианта в секвенированных образцах выросла с 0 процентов до более чем 50 процентов случаев. Его трансмиссивность оказалась на 24% выше, чем у немутантных вирусных штаммов, а у людей, инфицированных новым вариантом, в образцах мазков было в два раза больше вируса, чем у людей, инфицированных немутантными штаммами.