Исследователи опубликовали полную карту генома ключевых биомаркеров для выявления рака

Bluestar Genomics и Чикагский университет опубликовали полногеномную карту 5-гидроксиметилцитозина (5hmC) для нескольких типов тканей человека. Исследование, опубликованное в рецензируемом журнале Nature Communications , продемонстрировало высокую эффективность 5hmC в качестве глобального биомаркера для выявления множества серьезных заболеваний, таких как рак и различные хронические заболевания. В отличие от 5mC, который является меткой репрессии гена, 5hmC является меткой активации гена, представляющей один из наиболее распространенных путей, участвующих в регуляции эмбриогенеза, неврологических процессов и канцерогенеза. Новая карта способствует пониманию разнообразных биологических факторов, влияющих на различные заболевания, что необходимо для разработки диагностических тестов следующего поколения.

«Хотя предыдущие исследования показали, что 5hmC может служить отличным биомаркером для диагностики и прогнозирования заболеваний человека, включая рак , отсутствие ткани всего телакарта ограничивает наше глобальное понимание этого знака и его потенциальной тканевой специфичности », — говорит доктор Чуан Хе, профессор химии Чикагского университета и старший автор исследования.« Благодаря сотрудничеству с Bluestar Genomics, новая публикация значительно расширится. наше понимание этого глобального биомаркера, предоставляющее то, что, по нашему мнению, является самой широкой из известных карт тканей человека, которая каталогизирует модификации 5hmC. Новая карта подтверждает, что 5hmC является превалирующей меткой активации генов как для тел генов, так и для энхансеров с превосходной тканевой и типовой специфичностью, что является ключом к будущей ранней диагностике рака человека и мониторингу хронических заболеваний человека ».

В этом исследовании ученые из Чикагского университета в сотрудничестве с Bluestar Genomics оценили эффективность и воспроизводимость 5hmC в качестве биомаркера для 19 типов тканей из нескольких мужских и женских органов. Опубликованные результаты демонстрируют, что профили 5hmC, идентифицированные на новой карте, представляют собой беспрецедентную базу данных о потенциальных диагностических разработках, особенно в отношении рака.

На основе исследования 96 образцов, представляющих десять основных систем органов: нервную, сердечно-сосудистую, пищеварительную, репродуктивную, эндокринную, респираторную, мочевую, покровную, скелетную и лимфатическую, карта представляет собой наиболее полное исследование 5hmC как биомаркера для выявления рака. Данные подтверждают точность профилирования (Spearman r = 0,82 по сравнению с золотыми стандартными профилями TAB-seq) и воспроизводимость (Spearman r = 0,974) полногеномных профилей 5hmC, полученных в различных тканях, что подчеркивает их клиническую значимость и обеспечивает уникальный ресурс. изучить распределение 5hmC в геноме человека.

Основываясь на ранее опубликованной работе Bluestar Genomics, новая публикация подчеркивает, что 5hmC раскрывает известную биологию в тканях человека, позволяя измерять активность транскрипции и регуляции генов с помощью одного и того же анализа. Опубликованная карта, которая характеризует геномное распределение 5hmC в 19 тканях человека, полученных из десяти систем органов, закладывает основу для будущего развития диагностических тестов.

«С конечной целью разработки надежного скринингового теста на рак эта карта приближает нас на шаг ближе к расширению нашей способности точно считывать и интерпретировать сигналы рака, исходящие от опухолевых тканей в бесклеточной ДНК», — говорит Сэмюэл Леви, доктор философии. , Главный исполнительный и главный научный сотрудник Bluestar Genomics, соавтор исследования. «Я горжусь тем, что наша работа также внесет вклад в более широкое научное сообщество, углубив точное понимание учеными широты биологии за счет использования 5hmC».

Автор:

Читайте также

Если у вас остались вопросы, вы можете найти ответ в специальном разделе, либо задать свой вопрос нашим экспертам.

Вячеслав Голосов Вячеслав Голосов
  • ортопедия
  • врач 1 категории
  • 14 лет опыта
Андрей Ляховчук Андрей Ляховчук
  • травматология, ортопедия
  • врач 2 категории
  • 7 лет опыта
Задать вопрос врачу
Понравилась статья? Поделиться с друзьями:
Добавить комментарий

;-) :| :x :twisted: :smile: :shock: :sad: :roll: :razz: :oops: :o :mrgreen: :lol: :idea: :grin: :evil: :cry: :cool: :arrow: :???: :?: :!:

Содержание
Adblock
detector