Новое исследование Центра исследования недоношенных детей March of Dimes, проведенное под руководством исследователей из Чикагского университета, выявило новые генетические маркеры, связанные с продолжительностью беременности, что позволило по-новому взглянуть на потенциальные факторы риска преждевременных родов.
В сотрудничестве между несколькими лабораториями и при финансовой поддержке March of Dimes Foundation исследователи приступили к картированию важных регуляторных областей генов и генетических маркеров, относящихся к преждевременным родам. Их первая задача заключалась в устранении недостатка данных по функциональной геномике в типах тканей, имеющих отношение к беременности.
«Когда вы изучаете болезнь, в общедоступных базах данных обычно доступно множество генетических и тканевых ресурсов», — сказала соавтор исследования Кэрол Обер, доктор философии, заведующая кафедрой генетики человека в Калифорнийском университете в Чикаго. «Но состояния, связанные с беременностью, такие как преждевременные роды, получают гораздо меньше внимания или финансирования, и в результате ткани, связанные с беременностью, недостаточно хорошо представлены в этих базах данных».
В статье, опубликованной 2 декабря 2020 года в журнале Science Advances , основное внимание уделялось децидуализированным клеткам, полученным из клеток эндометрия, прикрепленных к плаценте. Децидуализированные клетки выстилают матку во второй половине менструального цикла, подготавливая ее к имплантации и поддерживая рост и развитие плаценты и плода на протяжении всей беременности.
Исследователи собрали плацентарную ткань, пожертвованную родившими пациентами, и изолировали децидуализированные клетки в лаборатории. Генетический анализ этих клеток выявил два новых гена- кандидата на преждевременные роды , HAND2 и GATA2.
«Оба эти гена являются важными факторами транскрипции, которые регулируют экспрессию нескольких других генов», — сказала соавтор исследования Айви Энеас, доктор философии, доцент кафедры генетики человека в Калифорнийском университете в Чикаго. «HAND2 опосредует действие прогестерона на эпителий матки, в то время как GATA2 участвует в поддержании стволовых клеток».
Известно, что оба эти процесса и гены, которые их контролируют, важны для децидуализации эндометрия и имплантации эмбриона.
«Тот факт, что мы определили связь между этими двумя генами и продолжительностью беременности, предполагает, что их роль во время беременности может быть более важной, чем предполагалось ранее», — сказал соавтор исследования Нобору Сакабе, доктор философии, научный сотрудник Калифорнийского университета в Чикаго. .
Понимание того, как эти гены влияют на продолжительность беременности, может стать ключом к разработке новых мер профилактики преждевременных родов.
«Исследователи признали ряд факторов, которые могут привести к преждевременным родам, от окружающей среды до инфекционных заболеваний и не только, но досадно то, что нам не удалось их предотвратить», — сказал соавтор исследования Марсело Нобрега, доктор медицины , Доктор философии, профессор генетики человека в Калифорнийском университете в Чикаго. «Наше исследование изучило генетику и позволило нам выявить некоторые связи, которые могли бы пролить свет на генетические пути и сигнальные молекулы, участвующие в процессе децидуализации, что, в свою очередь, могло бы предоставить новые мишени для лечения».
Исследователи смогли использовать комбинированный опыт в области генетики, геномики и статистического анализа человека, чтобы объединить данные, собранные из клеток эндометрия человека в лаборатории, с данными существующих полногеномных ассоциативных исследований (GWAS) для определения ключевых генетических вариаций, которые могут быть связаны. до преждевременных родов.
«Только шесть или семь участков генома были связаны с преждевременными родами и сроком беременности», — сказал соавтор исследования Синь Хе, доктор философии, доцент кафедры генетики человека в Калифорнийском университете в Чикаго. «Мы не знаем, какие гены задействованы или как это влияет на функцию клеток и риск преждевременных родов. С нашим подходом мы интегрировали данные геномики, полученные из нашего центра, и интегрировали их с другими базами данных для выявления лежащих в основе генетических взаимодействий. Это может привести к нас к генам, которые могут быть вовлечены в это состояние, что дает нам подсказку о лежащей в основе биологии «.
Загрузка...
