Среди вещей, за которые стоит поблагодарить за этот год, стоит отметить тот факт, что упорные, постоянные проблемы, похоже, имеют непреодолимое притяжение для ученых и математиков. Большинство из нас сбило бы с толку их хлеб насущный.
И это одна из причин, по которой исследователи добиваются прогресса в продолжающейся борьбе с раком, вирусами и другими заболеваниями.
Так обстоит дело с Абхьюдаи Сингхом, биологом-математиком, доцентом кафедры электротехнической и компьютерной инженерии, математических наук и биомедицинской инженерии Университета Делавэра и аффилированным преподавателем Центра биоинформатики и вычислительной биологии.
Сингх изучает, как биохимические процессы работают внутри живых клеток . В частности, он разрабатывает математические модели, которые дают представление о сложных, иногда скрытых процессах, вовлеченных в сотовые сети, и о том, что происходит, когда они выходят из строя.
Его вычислительная работа была важной частью совместной работы с командой Университета Пенсильвании, возглавляемой профессором Арджуном Раджем из Департамента биоинженерии Пенна. Их недавние выводы были опубликованы в журнале Cell . В статье, первым автором которой был доктор Сидней М. Шаффер, доцент Медицинской школы Перельмана Пенсильванского университета, показана новая потенциальная стратегия борьбы с устойчивыми к терапии клетками меланомы, которая может быть полезна против всех видов устойчивых видов рака.
Предоставлено: Университет штата Делавэр.
«Раковые клетки неоднородны даже в одной и той же опухоли», — сказал Сингх. «У некоторых есть лекарственная толерантность и выживает терапия. Затем они восстанавливаются… Теперь мы обнаружили молекулярные механизмы, задействованные в этих устойчивых к лекарствам клетках, которые имеют значение для терапии и могут применяться к различным типам рака».
Цель состояла в том, чтобы идентифицировать все гены, которые вызывают толерантность к лекарствам в клетках, в надежде затем наметить способ обойти их способность выжить при таком лечении.
Команда изучала колебания в способах выражения клетками своих генетических черт, включая их «включение» и «выключение». Этот процесс зависит от молекул информационной РНК, которые преобразуют генетический код в определенные белки.
Они обнаружили, что подмножество редких клеток несут биологическую «память», которая может пережить несколько поколений клеточного деления.
Модель Сингха показывает, как скорость генетических колебаний клеток связана с уровнями информационной РНК в клетках. Знание этих уровней позволяет его модели вычислить, насколько быстро эти гены «включаются» и «выключаются».