Международная группа исследователей, возглавляемая Исследовательским институтом трансляционной геномики (TGen), филиалом City of Hope, и Институтом исследований и инноваций HonorHealth, подробно описала отдельные клетки, составляющие микросреду рака поджелудочной железы, что является важным шагом в разработке. новые возможности лечения пациентов с этим агрессивным и трудноизлечимым заболеванием.
Результаты исследования были опубликованы сегодня в научном журнале Genome Medicine , издании Springer Nature.
Исследователи использовали относительно новый метод, известный как секвенирование одной клетки, для генетической идентификации типов и подтипов клеток, встречающихся в опухолях поджелудочной железы , и выявления различных клеток в строме опухоли , вещества, окружающего опухоль, которое может скрыть рак от рака. иммунная система организма.
Хотя одноклеточная транскриптомика ранее использовалась для изучения клеточного состава первичных опухолевых тканей протоковой аденокарциномы поджелудочной железы (PDAC), в этом исследовании также использовалась технология для профилирования отдельных клеток из диссоциированных первичных опухолей и биопсий метастатических тканей, тех раковых поражений, которые распространились по телу из первичной опухоли.
Это исследование было проведено в сотрудничестве с исследователями из Медицинского центра Samsung и City of Hope, всемирно известного независимого центра исследований и лечения рака, диабета и других опасных для жизни заболеваний. Первичные опухоли и биопсия центральной иглы метастатических поражений от пациентов с PDAC были секвенированы с использованием платформы Chromium single cell RNA-Seq.
«Анализ транскриптома единичных клеток может предложить важную клиническую информацию об отдельных клеточных субпопуляциях и дать подсказки для разработки новых терапевтических стратегий как для таргетной терапии, так и для иммунотерапии», — сказал Хайён Хан, доктор философии, профессор отдела молекулярной медицины TGen и руководитель отдела Лаборатория исследования рака поджелудочной железы.
«Понимание разнообразия и сложности опухоли PDAC и стромальных компартментов в отдельных опухолях может помочь определить уникальные точки вмешательства и потенциально дать информацию о стратегиях лечения и поддержки пациентов с запущенным заболеванием», — сказал доктор Хан, старший автор исследования.
В ходе анализа были идентифицированы различные типы и подтипы клеток, включая опухолевые клетки, эндотелиальные клетки, связанные с раком фибробласты и иммунные клетки, а уровни экспрессии различных генов в отдельных популяциях клеток коррелировали с клиническими исходами пациентов.
«Работая с нашими партнерами и коллегами, используя технологию секвенирования отдельных клеток, мы можем продолжать узнавать больше о биологии рака поджелудочной железы. Эти идеи могут потенциально помочь нам определить больше вариантов лечения для наших пациентов», — сказал Эркут Боразанчи, доктор медицинских наук, MS, онколог и врач-исследователь в Исследовательском и инновационном институте HonorHealth, клинический доцент TGen и один из авторов статьи.
Рак поджелудочной железы — агрессивное заболевание с высокой смертностью. Это третья по значимости причина смерти от рака в США после рака легких и колоректального рака. В 2020 году пятилетняя выживаемость при раке поджелудочной железы составляет всего около 10%, хотя это прогресс по сравнению с мрачными 6% в 2014 году.
Затем исследователи планируют использовать более продвинутый анализ пространственной транскриптомики отдельных клеток для дальнейшего изучения клеточных отношений, связанных с показателями выживаемости, с использованием методов в реальном времени. Более широкое использование этой технологии потенциально может привести к поиску новых агентов для лечения рака поджелудочной железы.