Секвенирование одноклеточной РНК раскрывает подробности

Международная группа исследователей, возглавляемая Исследовательским институтом трансляционной геномики (TGen), филиалом City of Hope, и Институтом исследований и инноваций HonorHealth, подробно описала отдельные клетки, составляющие микросреду рака поджелудочной железы, что является важным шагом в разработке. новые возможности лечения пациентов с этим агрессивным и трудноизлечимым заболеванием.

Результаты исследования были опубликованы сегодня в научном журнале Genome Medicine , издании Springer Nature.

Исследователи использовали относительно новый метод, известный как секвенирование одной клетки, для генетической идентификации типов и подтипов клеток, встречающихся в опухолях поджелудочной железы , и выявления различных клеток в строме опухоли , вещества, окружающего опухоль, которое может скрыть рак от рака. иммунная система организма.

Хотя одноклеточная транскриптомика ранее использовалась для изучения клеточного состава первичных опухолевых тканей протоковой аденокарциномы поджелудочной железы (PDAC), в этом исследовании также использовалась технология для профилирования отдельных клеток из диссоциированных первичных опухолей и биопсий метастатических тканей, тех раковых поражений, которые распространились по телу из первичной опухоли.

Это исследование было проведено в сотрудничестве с исследователями из Медицинского центра Samsung и City of Hope, всемирно известного независимого центра исследований и лечения рака, диабета и других опасных для жизни заболеваний. Первичные опухоли и биопсия центральной иглы метастатических поражений от пациентов с PDAC были секвенированы с использованием платформы Chromium single cell RNA-Seq.

«Анализ транскриптома единичных клеток может предложить важную клиническую информацию об отдельных клеточных субпопуляциях и дать подсказки для разработки новых терапевтических стратегий как для таргетной терапии, так и для иммунотерапии», — сказал Хайён Хан, доктор философии, профессор отдела молекулярной медицины TGen и руководитель отдела Лаборатория исследования рака поджелудочной железы.

«Понимание разнообразия и сложности опухоли PDAC и стромальных компартментов в отдельных опухолях может помочь определить уникальные точки вмешательства и потенциально дать информацию о стратегиях лечения и поддержки пациентов с запущенным заболеванием», — сказал доктор Хан, старший автор исследования.

В ходе анализа были идентифицированы различные типы и подтипы клеток, включая опухолевые клетки, эндотелиальные клетки, связанные с раком фибробласты и иммунные клетки, а уровни экспрессии различных генов в отдельных популяциях клеток коррелировали с клиническими исходами пациентов.

«Работая с нашими партнерами и коллегами, используя технологию секвенирования отдельных клеток, мы можем продолжать узнавать больше о биологии рака поджелудочной железы. Эти идеи могут потенциально помочь нам определить больше вариантов лечения для наших пациентов», — сказал Эркут Боразанчи, доктор медицинских наук, MS, онколог и врач-исследователь в Исследовательском и инновационном институте HonorHealth, клинический доцент TGen и один из авторов статьи.

Рак поджелудочной железы — агрессивное заболевание с высокой смертностью. Это третья по значимости причина смерти от рака в США после рака легких и колоректального рака. В 2020 году пятилетняя выживаемость при раке поджелудочной железы составляет всего около 10%, хотя это прогресс по сравнению с мрачными 6% в 2014 году.

Затем исследователи планируют использовать более продвинутый анализ пространственной транскриптомики отдельных клеток для дальнейшего изучения клеточных отношений, связанных с показателями выживаемости, с использованием методов в реальном времени. Более широкое использование этой технологии потенциально может привести к поиску новых агентов для лечения рака поджелудочной железы.

Автор:

Читайте также

Если у вас остались вопросы, вы можете найти ответ в специальном разделе, либо задать свой вопрос нашим экспертам.

Вячеслав Голосов Вячеслав Голосов
  • ортопедия
  • врач 1 категории
  • 14 лет опыта
Андрей Ляховчук Андрей Ляховчук
  • травматология, ортопедия
  • врач 2 категории
  • 7 лет опыта
Задать вопрос врачу
Понравилась статья? Поделиться с друзьями:
Добавить комментарий

;-) :| :x :twisted: :smile: :shock: :sad: :roll: :razz: :oops: :o :mrgreen: :lol: :idea: :grin: :evil: :cry: :cool: :arrow: :???: :?: :!:

Содержание
Adblock
detector