Всесторонний «протеогеномный» анализ белков, генов и транскрипции РНК, участвующих в опухолях головного мозга у детей, дал более полное представление об этих опухолях, которые являются основной причиной смерти детей от рака. Результаты могут помочь врачам более точно идентифицировать различные типы опухолей и методы их лечения.
Исследователи из Консорциума клинического протеомного анализа опухолей (CPTAC) и Сети детских опухолей головного мозга (CBTN) собрали и проанализировали так называемые генетические, геномные и протеомные данные о множественных типах опухолей головного мозга у детей. Консорциум состоит из сотрудников из Медицинской школы Икана на горе Синай, Национального института рака, Онкологического исследовательского центра Фреда Хатчинсона, Детской национальной больницы и Детской больницы Филадельфии. Исследование, первое крупномасштабное многоцентровое исследование, посвященное опухолям головного мозга у детей, было доступно в сети в Cell 25 ноября.
«Педиатрический рак в целом и детские опухоли головного мозга в частности имеют относительно низкую мутационную нагрузку», — объясняет Пей Ван, доктор философии, ведущий автор исследования и профессор генетики и геномных наук в Медицинской школе Икана. Гора Синай. «Таким образом, всесторонняя характеристика функциональной молекулярной биологии этих опухолей, включая протеогеномный анализ, проведенный в этом исследовании, имеет важное значение для лучшего понимания и лечения детских опухолей головного мозга».
Это исследование является первым всесторонним обзором геномики (цель которой — охарактеризовать изменения последовательности ДНК в образце), транскриптомики (которая направлена на количественное определение копий РНК), глобальной протеомики (которая направлена на идентификацию и количественную оценку белков) и фосфопротеомики (которая дает количественную оценку активные белки) в большой когорте из 218 образцов опухолей, представляющих семь различных типов опухолей головного мозга.
Характеризуя биологические темы, которые являются общими для этих различных типов опухолей, исследование выявило новые идеи, предполагающие, что текущие методы лечения, используемые для определенных типов опухолей, могут быть применены к другим, которые имеют те же протеомные особенности. В частности, анализ выявил две отдельные подгруппы детской краниофарингиомы, типа детской опухоли головного мозга. Одна подгруппа продемонстрировала протеомные / фосфопротеомные характеристики, поразительно похожие на таковые для другого типа опухоли, известной как «глиома низкой степени злокачественности (LGG) с мутацией BRAFV600E». Это наблюдение предполагает, что ингибиторы MEK / MAPK, тип химиотерапии, который использовался против опухолей с мутацией LGG с BRAFV600E, также могут помочь в этой подгруппе детских краниофарингиом, которая в настоящее время не имеет надежных химиотерапевтических вариантов.
Загрузка...
