У людей с разными генетическими вариантами компонентов иммунной системы часто очень разные иммунные ответы на Sars-CoV-2. У них также будет разная реакция на вакцины. К тому же недавно появившиеся варианты Sars-Cov-2 могут вызывать разные иммунные ответы в идентичных иммунных системах. В более широкой реальности, с которой мы сейчас имеем дело, необходимо одновременно учитывать возможные вариации всего вышеперечисленного.
Недавно мы обсудили несколько источников недавно открытых вариаций иммунных генов, которые контролируют восприимчивость к Sars. Например, современные люди с возвратными версиями неандертальского гена DPP4 или протеазы TMPRSS2, расщепляющей спайковый белок, по-видимому, подвержены высокому риску тяжелой формы Covid. Другие варианты, такие как высокоэкспрессируемый ген TMEM1B , распространенный у жителей Восточной Азии, или гены пути синтеза сульфата гепарина, помогают объяснить непропорциональную тяжесть COVID-19 в некоторых группах населения.
Две статьи, одна из которых недавно опубликована в журнале Nature Immunology , а другая в журнале Science , теперь расширяют список появляющихся генов и включают вариации в структуре антител, которые вызываются вирусом или вакциной. Эти варианты включают особый вид посттрансляционной модификации анти-RBD (рецепторсвязывающего домена) распространенного подкласса IgG1, известного как афукозилирование. По сути, это означает, что по той или иной причине в афукозилированном антителе отсутствует добавление молекулы фукозного сахара в ключевом структурном месте.
Чтобы лучше представить себе влияние этой ситуации, рассмотрим приведенное выше изображение стандартной молекулы антитела IgG. Вариабельная часть, ветви Y- образной молекулы, известна как Fab-область, и она содержит эпитопы, которые взаимодействуют с белком шипа вируса. Область единственного основания содержит константный фрагмент Fc и, между прочим, гликозилированное украшение, свисающее с положения N297, которое потенциально содержит фукозу. При почти фрактальной идиосинкразии этот набор гликоформ также имеет двухантенную структуру, аналогичную родительскому антителу, только в гораздо меньшем масштабе и с различными сахарами вместо аминокислот. Сама фукоза свисает со стержневой части агрегированной гликоформы, так же как эти гликаны, в свою очередь, прикрепляются к антителу.